可以通过ChIP-seq技术预测增强子


Kate AndertonB.Sc.Dec 23
2018
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在遗传学中,增强子是DNA的一个短区域,可以被蛋白质结合,以增加特定基因转录发生的可能性。这些蛋白质通常被称为转录因子。增强剂使研究人员能够理解基因表达的过程。增强子的功能不依赖于靶基因的距离和方向。但是,很难找到增强剂。新技术(ChIP-seq(染色质免疫沉淀测序))正在出现,通过它可以预测增强子。

 

相关故事科学家致力于更好和永久性治疗癫痫研究:HIV感染细胞的重新激活取决于其大小和细胞周期。大学科学家开发合成蛋白质开关来控制电子流量大多数方法基于p300结合位点和/DNAI过敏位点(DHSs)为了收集有时不精确且导致预测性能不令人满意的积极训练样本。在本文中,提出了基于支持向量机的方法,通过使用EnhancerAtlas来研究细胞系和组织中增强子的存在。已经在与心脏和肺组织相关的疾病模型中进行了增强子预测。

 

实验结果表明,所提出的方法甚至比早先在特定细胞系中提出的其他现有技术方法表现得更好。研究结果还表明,在成人或年轻组织样本中预测增强子更容易,而不是在胎儿样本的实验中。

 

 

资料来源:https//benthamscience.com/


 


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